Как ученые ищут «нулевого пациента» пандемии
Ученые все еще находятся в поиске нулевого пациента COVID-19.
Кроме любопытства и желания совершить открытие, ученые преследуют три основные цели при выявлении «нулевого пациента»: выяснение происхождения инфекции; получение информации о том, как предотвратить возникновение вспышек заболеваемости; предотвращение немедленного распространения болезни на территории, где она впервые была обнаружена.
Само понятие «нулевой пациент» родилось из-за ошибки перевод. в начале эпидемии ВИЧ в начале 1980-х. Первого ВИЧ-инфицированного в официальных документах называли «пациент О», а в СМИ его назвали «нулевым». Ученые называют первый случай заражения — индексным случаем, а первого зараженного человека — первичным случаем.
С начала пандемии COVID-19 считалось, что первичный случай был обнаружен на рынке морепродуктов в Ухани, но китайские ученые считают, что SARS-CoV-2 начал распространяться гораздо раньше.
Поиск первичного случая начинается с определения типа возбудителя заболевания. В случае COVID-19 — это зооноз — так называют заболевания, вызванные патогенами, которые переходят от животного к человеку. Это может быть вызвано разными причинами: «вторжение» человека в естественную среду обитания животных, изменение пищевых привычек человека или изменение климата. Другие примеры зоонозных заболеваний — это лихорадка Эбола, свиной и птичий грипп, вирус Зика или ВИЧ.
Популярная гипотеза гласит, что «нулевой пациент», прежде чем стал таковым, съел мясо змеи или ящера панголина, которые могли быть промежуточным звеном между человеком и летучей мышью.
Чтобы отыскать переносчика зооноза, ученые сравнивают ДНК патогена (организма, вызвавшего заболевание) у людей и животных. Чем больше совпадений в последовательности нуклеотидов, составляющих геном, тем более близки ДНК патогенов. Близость последовательностей указывает ученым на животного-хозяина вируса. Для SARS-CoV-2, поражающего человека, наиболее близким совпадением (96%) оказался вирус летучих мышей RaTG13. Кроме этого, SARS-CoV-2 накапливает мутации так же, как патоген рукокрылых. Но специалисты не берутся окончательно называть источник, потому что животные активно взаимодействуют друг с другом и могут обмениваться вирусами. Как мы уже говорили, ученые считают, что переносчиком SARS-CoV-2 стало мясо змеи или ящера, но вирус панголина идентичен SARS-CoV-2 только на 91%. До сих пор ученые не сходятся во мнении, ведь небольшие, на первый взгляд, 4% или 9% не доказывают предка SARS-CoV-2.
Осложняют понимание и происходящие мутации, которые случаются при каждой передаче вируса от организма к организму. Ученые называют их штаммами. На сегодняшний момент известно более тысячи штаммов коронавируса, ученые даже научились предсказывать появление новых за пять месяцев. Процесс трансформации вируса связан с изменением гена спайкового белка и изменением наборов нуклеотидов в других генах.
Для того чтобы связать все мутации, ученые строят генеалогическое древо SARS-CoV-2. Они сравнивают последовательности вирусных образов и строят взаимосвязи на основе генетических сходств и различий. Сегодня доступны десятки тысяч различных последовательностей SARS-CoV-2, и их сравнение, — трудоемкая работа.
Нулевой пациент был носителем первого штамма — это корень генеалогического дерева вирусов, из которого последовательными мутациями получаются все остальные штаммы. Но первичный случай COVID-19 до сих пор неизвестен.
Рынок морепродуктов является источником первой массовой вспышки, однако первый диагноз заражения болезнью, которую только через несколько месяцев назвали COVID-19, поставили 1 декабря 2019 года, на месяц раньше, чем власти Китая объявили о первом официальном случае.
Практически все ученые согласны, что SARS-CoV-2 не был разработан в лаборатории в Ухане, где якобы произошла случайная утечка. При сравнении генетической последовательности RaTG13 (вирус летучих мышей) с SARS-CoV-2 различия случайным образом распределяются по геному. В спроектированном вирусе, считают ученые, были бы четкие блоки изменений, которые представляют собой введенные последовательности из другого вирусного источника.
По материалам scienceabc.com
Хорошо ли работает мозг? Ответили на 46, то Вы блеснули знаниями на «Ура»